함선전 모드는 공격팀과 방어팀으로 나눠 공격팀은 함선을 공격해 파괴, 방어팀은 공격팀을 막아내 함선이 파괴 되지 않도록 방어하는 미션이다. 정해진 시간 내에 공격팀이 함선을 파괴하거나 시간이 전부 소진 되면 공격팀과 방어팀은 서로 역할을 바꿔 같은 미션을 반복 하게 된다. 최종적으론 더 많은 함선을 파괴하는 팀이 승리 한다. 마치 축구의 승부차기와 같은 것이라 보면 된다.
비버게임즈 김홍태 이사는 "1차 오픈베타 테스트에선 개인전과 팀전의 2가지 방식의 대전 밖에 없었다. 게임을 보다 재미있게 즐기려면 많은 콘텐츠가 있어야 하며, 유저가 취향에 맞게 콘텐츠를 선택해야 하는데 제로기어스는 그런 점에서 보면 불합격이었다. 그래서 콘텐츠 추가의 필요성을 느끼고 이번 모드를 개발하게 되었다. 앞으로 더 많은 콘텐츠를 추가할 예정이니 기대해 달라"고 밝혔다.
