일본 세가의 원작 게임을 한국 프로야구 실정에 맞게 현지화하는데 성공한 '프로야구매니저'는 이용자의 개성을 표현할 수 있는 '구단 엠블럼 변경권'을 출시한다. 이 변경권을 이용하면 이용자는 선호구단의 우승 년도 엠블럼이나 과거 엠블럼으로 변경할 수 있다. 예를 들어 SK 와이번스가 선호구단인 이용자는 2007년 시리즈 우승 엠블럼으로 변경할 수 있다.
또한, 선수 비교 옵션 기능이 추가돼, 이용자는 좀 더 정확하게 선수들의 능력치를 비교할 수 있다. 옵션 기능을 이용하면 유학, 코치, 팀컬러 등 특정 효과를 제거한 선수들 능력치 비교가 가능하다. 이 밖에도 '프로야구매니저'는 '팀 서포트 카드'를 클릭하면 팀 내 어느 선수가 영향을 받는지 보여주는 기능도 추가한다.